QX200
Система для цифровой капельной ПЦР
Новый уровень чувствительности, воспроизводимости и стабильности в количественной ПЦР
Поговорить с экспертом
Преимущества
Точное определение CNV
Геномные изменения, такие как вариация числа копий гена или CopyNumberVariation (CNV), когда копий гена в геноме становится либо слишком много, либо слишком мало относительно нормы, что приводит к фенотипическим изменениям, включая заболевания, часто онкологические, неврологические и аутоимунные. Капельная цифровая ПЦР позволяет измерять до 1,2x различий в копийности гена, что существенно превосходит возможности ПЦР в режиме реального времени, особенно в области большого количества копий (3 и более).
Детекция изменения уровня экспрессии генов от 10%
Количественная ПЦР с обратной транскрипцией (RT-qPCR) – широко распространенный метод, используемый в исследованиях экспрессии генов. Данный метод является эффективным, чувствительным и обладает широким динамическим диапазоном. За счет высокой воспроизводимости результатов и, как следствие, низкого «шума» данных, цифровая ПЦР позволяет детектировать даже небольшие (от 10%) изменения в уровне экспрессии генов, что открывает новые возможности в изучении взаимодействия генов и регуляции их экспрессии.
Устойчивость к ингибированию
Строго говоря, это не устойчивость к ингибированию, а меньшая зависимость результатов от эффективности ПЦР, по сравнению с ПЦР в режиме реального времени. Так как сигнал в цифровойПЦР детектируется по конечной точке и строить S-образные кривые не требуется, то достаточно, чтобы флуоресцентный сигнал компартментов, содержащих ДНК-мишень, отличался от сигнала компартментов без мишени, чтобы получить достоверные результаты.
Основные применения
Детекция онкомутаций и CNV.
Высокие чувствительность и воспроизводимость системы QX200 активно применяются для детекции соматических мутаций, оценки копийности генов (CNV) и количественной оценки свободной циркулирующей ДНК опухоли в кровотоке методом жидкой биопсии.
Детекция SARS-CoV2 и других патогенов.
Преимущества в детекции образцов с низкой вирусной нагрузкой позволяют цифровой капкльной ПЦР точнее детектировать SARS-CoV2, существенно сокращая долю ложно отрицательных результатов при тестировании и таким образом точнее выявляя бессимптомных носителей.
Детекция ГМО, тестрование сельскохозяйственной продукции, экологические исследования.
Высокие чувствительность и воспроизводимость системы QX200 активно применяются для детекции соматических мутаций, оценки копийности генов (CNV) и количественной оценки свободной циркулирующей ДНК опухоли в кровотоке методом жидкой биопсии.
Геномное редактирование.
Система QX200 помогает как на этапе оптимизации протокола трансфекции, детектируя не только количество полученных трансфектов, но соотношение HDR к NHEJ, так и на этапе селекции полученных трансфектов в процессе клеточного культивирования, существенно сокращая количество клонов на этапе скрининга для отбора клеток с требуемыми изменениями.
Экспрессия генов, детекция микроРНК.
Прямое, а не относительное количественное определение, без построения калибровочной кривой, дают высокую стабильность и воспроизводимость результатов цифровой капельной ПЦР (ddPCR) и позволяют детектировать даже небольшие (от 10%) изменения в уровне экспрессии генов.
Эпигенетика. Определение сцепленности признаков (linkage, phasing).
Определение степени метилирования. Изящный подход к оценке сцепленного наследования (linkage). Определение гаплотипа и позиции полиморфизма на хромосомах (phasing).
Поиск публикаций с использованием цифровой ПЦР
Кликнув по ссылке ниже Вы сможете перейти на страницу Био-Рад, где собрана информация о более чем 5000 статьях*, в которых использовалась цифровая ПЦР. Страница постоянно обновляется новыми публикациями.
Простая навигация. Возможность поискать по гену, по теме, по автору и т.д. Очень рекомендуем!
*сайт не дает полный текст статей, чтобы не нарушать авторских прав, но предоставляет доступ к абстракту статьи.
